Все вместе сшивается, реестр потом справки по порядку, если почтой слать(работников меньше пяти) то в трех экземплярах, два туда один себе оставь. Если с дискетой и сдавать натурой :D то в реестр в двух экз, а справки можешь в одном и вперед на баррикады.